El rechazo público de Regeneración a participar en “La procesión de la Paz”, organizada por la prensa citadina como parte de las fiestas en honor de Porfirio Díaz, a realizarse a partir del 1 de diciembre de 1900, provoca su primer enfrentamiento directo con la prensa oficial porfiriana y acelera la primera ruptura, al interior de su dirección, que sufrirá el semanario al separarse de ella el abogado Antonio Horcasitas. El semanario abandona temporalmente las oficinas en las que había surgido y se traslada al modesto Callejón de Dolores, aunque mantiene el mismo número telefónico. El cambio también se refleja en su lema: el original, “Periódico Jurídico Independiente”, da paso a “Periódico Independiente de Combate”.  Cuando Horcasitas deja sus oficinas en el Centro Mercantil, Regeneración regresa a ese despacho. A lo largo de esta primera época de Regeneración, Ricardo Flores Magón entró en contacto con una centena de grupos liberales del interior de la república y cerca de doscientas publicaciones de la misma tendencia.